Outro problema relacionado ao MCP é o fato de que o mecanismo de geração de flutuações primordiais de densidade é totalmente desconhecido. Como um universo homogêneo e isotrópico pôde dar origem a estruturas como galáxias, aglomerados e superaglomerados? Uma possível solução para esses problemas é fornecida pelo modelo inflacionário sugerido por Alan Guth, em 1981.